控制箱體內的溫度，通常在箱體內壁安裝熱感應器，如接觸溫度計、電阻溫度計等，用來作為溫度測量和調節裝置的變壓器，又可作為控制熱源（如電熱器）通斷的電訊信號開關。即箱體內部溫度達到培育豆芽所需的****溫度（27度）時，熱感應器就能自動發出信號，切斷通電線路而停止加熱。相反，當箱體內部溫度低于27度時，熱感應器又能自動發出信號，接通電熱線路而進行及時加熱。

由于豆芽機在培育豆芽時可自動控制溫度，使豆芽生長在適宜的恒溫條件下，克服了手工操作時溫度變化不定的某些弊端，從而促進了豆芽的生長，縮短了培育時間。

豆芽機的溫度自動控制與調節范圍，一般在18-35度之間，但實際使用時，多選用27度左右。